大氣采樣器由于是精密儀器，在使用中會非常繁雜，但是為了保證大氣采樣器的良好工作，必須遵循以下10條才能長期使用。
1.采樣前向吸收瓶中加入與采樣的吸收液等量的水，用軟管連接氣路后接通電源，為了避免現場調整引起的流量誤差，將流量調整為采樣的實際流量。
2.將儀器置于采樣工作狀態，前后轉動調節按鈕，觀察流量計的柔軟性、有無死區、浮子的穩定性等。
3.在取樣過程中，連接過濾器，一方面對空氣進行過濾。由于大氣中的灰塵、氣溶膠傳播、酸堿氣體等異物容易隨著氣流被吸入泵內，這些異物附著在網上會影響隔膜泵的流量、抽吸壓力和穩定性，會降低設備的技術性能;另一方面，發生溶液回吸時，如果溶液通過過濾器的過濾纖維，過濾纖維會馬上膨脹，堵塞吸氣通路，使溶液不會進一步流入隔膜泵內，從而保護泵。如果發生溶液逆流，只需要清洗過濾器，更換過濾器纖維和泡沫苯乙烯的塊就可以解決問題。
4.操作中偶爾不慎吸入酸堿溶液時，立即注入蒸餾水清洗幾次，使泵間歇工作一定時間后，用無水乙醇溶液注入幾次進行清洗(清洗時泵的出口脫離緩沖器和流量計等，連接軟管進行排液)。然后，分別清洗緩沖器、流量計等，晾干后再使用。將機器放回原處后，可以讓機器空轉30分鐘左右，或者只有在出口處聞不到酒精的味道時才能正常使用，恢復正常。
5.頻繁使用或使用時間較長時，也要更換過濾器內的過濾纖維和泡沫塊，以防止污物通過過濾質進入泵內，防止空氣阻力增大，降低流量。
6.裝置的使用時間較長，或者觀察到流量計的柔軟性和不穩定性時，請清洗流量計，使裝置整體處于良好的工作狀態。
7.發現干燥瓶的干燥劑從蘭花變紅時，請迅速更換。更換干燥劑后，請連接配管系統，以免空氣泄漏。
8.一般機器不防爆，所以絕對不要在有爆炸危險的地方使用。
9.機器長期停車時，為了去除機內的濕氣，必須取出機內的電池，定期給機器通電30分鐘后運行。
10.使用時，吸收瓶的進出口不能顛倒，以免吸收劑吸入泵內發生故障。
